寵物小精靈一般指精靈寶可夢（湯山邦彥執導的日本動畫系列）
《精靈寶可夢》（ポケモン）是由湯山邦彥執導的電視動畫系列，改編自口袋妖怪系列遊戲。
動畫的日文版根據遊戲原作版本，可按照時間順序劃分為五部：《精靈寶可夢無印篇》、《精靈寶可夢超世代》、《精靈寶可夢：鑽石與珍珠》、《精靈寶可夢：超級願望》和於2013年10月開始播放並正在連載的《精靈寶可夢XY》。
除電視動畫系列外，神奇寶貝系列作品同樣包括一些旁支作品：描述非主角一行的角色的故事的週刊精靈寶可夢放送局、精靈寶可夢星期天、PokémonSmash!等。
精靈寶可夢無印篇
主詞條：精靈寶可夢無印篇
在無印篇中，新手訓練家小智從大木博士那裡獲得的是一隻勉勉強強又喜怒無常又不喜歡進入神奇寶貝球的皮卡丘，小智離開家鄉真新鎮，在關都地方展開他的旅程。在贏得皮卡丘的信任後，小智認真地開展他的旅程來挑戰各地的道館，參加神奇寶貝聯盟。在旅途中加入小智的是兩位良師益友——小剛和小霞。
參加石英大會之後，小智受大木博士之託啟程前往橘子群島，從內木博士處取得GS球，小剛暫時留在內木博士處。旅途中小智參賽橘子聯盟，還遇到神奇寶貝觀察家小建，便與他一同旅行。回到真新鎮後，大木博士無法理解怎麼樣把GS球開啟，所以就把小建留下做助手，派小智、小霞、小剛前往城都地區，把GS球交給檜皮鎮的鋼鐵先生。再次，小智參加了神奇寶貝聯盟－城都聯盟的白銀大會。
精靈寶可夢超世代
主詞條：精靈寶可夢超世代
城都聯盟篇結束後，小霞為了接替出門旅行的三位姐姐而不得不返回
超世代中主人公神奇寶貝最終陣容(18張)
華藍市擔任道館訓練家，小剛也因為因家裡有事和小智分離了。小智重新出發，基於想要以一個新人的心態繼續學習的心態，所以只帶著皮卡丘隻身前往豐緣地區，在那裡認識了新人訓練家小遙和其弟弟小勝，後來小剛又重新加入，於是四人並展開全新的冒險。
超世代共分為豐緣聯盟及對戰開拓區兩篇，和第一部的不同之處是，故事變成了兩條主線：一方面小智為了參加豐緣聯盟，努力挑戰道館而收集徽章。聯盟大會結束後，則改挑戰故鄉關都地區的對戰開拓區；另一方面小遙則以成為頂級協調訓練家為目標，挑戰各地的華麗大賽取得緞帶，參加華麗大型慶典。兩人都為了達成各自的目標，與神奇寶貝一同奮鬥。
精靈寶可夢鑽石與珍珠
主詞條：精靈寶可夢：鑽石與珍珠
對戰開拓區篇結束後，小遙為了獨自挑戰城都地區的華麗大賽和小智告別，小勝回到了橙華道館。小智則受到了小茂的鼓勵，獨自帶著皮卡丘和偷渡的長尾怪手前往神奧地區開始新的挑戰。
小智、小光和小剛3人的旅程並非一帆風順，他們在路途上遇上很多人和事，小智曾慘敗給真司，小光也曾在2次華麗大賽的第一次審查慘遭淘汰出局。幾經辛苦，小光終於集齊5枚緞帶徽章，她在神奧華麗大型慶典表示出色，首次參加便晉級至決賽，但在決賽以稍微差距敗於好友小望；小智亦集齊8枚徽章，他在神奧聯盟有好開始，在第1回戰打敗尚志，第2回戰打敗某女路人，第3回戰(16強)打敗考平，8強更打敗真司，可是他無法勢如破竹而在準決賽慘敗於達克多，4強出局。
神奧之旅隨著神奧聯盟結束而來到尾聲，小智及小剛曾邀請小光一同前往關都地方，但小光因卷卷耳被邀請而不能前來，當天日落，小智在碼頭上和小光以最後一次擊掌道別，與皮卡丘及小剛乘船返回關都地方。翌日日出後，小智和小剛回到關都地方，在往真新鎮及尼比市的分叉路口，小智和小剛握手及互相祝福對方後正式告別。小智和皮卡丘終於看見真新鎮，他們跑進返回真新鎮前的最後一段路，神奧之旅正式劃上句號。[3]
精靈寶可夢：超級願望
主詞條：精靈寶可夢：超級願望
講述小智和皮卡丘踏入新的冒險舞臺——合眾地區，這裡居住著許多他們所不知道的神奇寶貝。當小智知道合眾地區亦有神奇寶貝聯盟後，便馬上報名和踏上新的旅程，途中更遇上艾莉絲、牙牙與天桐，新的冒險就這樣開始了。而冒險隨之而來的是脫胎換骨的火箭隊，另外在尋找新的神奇寶貝以及新的邂逅的道路上，有更多的考驗在等著他們。
隨著小智取得8個徽章,日本於2012年6月21日播放“Season2”，講述小智一行人於合眾聯盟開始前，前往東合眾地區參加神奇寶貝世界錦標賽青少年杯為開端的故事。後來小智在合眾聯盟8強出局，隨後於2013年1月17日開始播出第2季的新章節“EpisodeN”，重新詮釋因311日本大地震而未能如期播出有關的等離子隊劇情。
“EpisodeN”結束後，於2013年4月25日播出第2季的另一新章節“傑可羅拉冒險”，故事中小智一行人離開合眾地區，返回關都，期間經過傑可羅拉群島，並在群島展開冒險旅程。
精靈寶可夢XY
立志成為神奇寶貝大師的小智帶著皮卡丘來到了卡洛斯地區，心中懷著新的理想告別了合眾地區的同伴天桐和艾莉絲，在卡洛斯地區與新認識的旅行夥伴瑟蕾娜、檸檬、尤莉卡三人和新的神奇寶貝相遇的冒險故事。