2005年衛生部下發規定要求醫師在接診過程中，對體溫38C，伴有呼吸道症狀(鼻塞、流涕、咳嗽、咽喉腫痛、氣促、呼吸困難等)的急性呼吸道發熱病
人，要首先為其提供醫用外科口罩，避免交叉感染，規定感染性疾病科和分診點的醫師要採取標準安全防範措施，需要佩戴醫用口罩。
一、執行標準不同
目前這三類口罩的技術標準為《一次性使用醫用口罩》（YY/T）、《醫用外科口罩》（YY）、《醫用防護口罩技術要求》（GB），可以透過檢視產品外包裝上標註的執行標準來判斷產品屬於哪類口罩。
二、效能不同
這三類口罩對細菌過濾效果的要求是相同的，主要區別在於防水性和顆粒過濾效率兩個方面。防水效能測量的是口罩在遇到血液、體液飛濺時的抗穿透能力。醫用外科口罩與醫用防護口罩均有防水性與顆粒過濾效率兩個方面效能的要求，而一次性用藥口罩則沒有；其次，醫用外科口罩的防水效能要高於醫用防護口罩；第三，醫用防護口罩的顆粒過濾效率效能要高於醫用外科口罩。
三、適用場合不同
醫用防護口罩具有良好的顆粒過濾效率，適用於醫務人員接觸空氣傳播和飛沫傳播疾病患者時的職業防護；醫用外科口罩具有良好的防水效能以及顆粒過濾效率，適用於手術、鐳射治療、隔離及牙科或其他醫療操作時的佩戴，以及空氣或飛沫傳播疾病或者佩戴；而一次性醫用口罩由於沒有防水效能和顆粒過濾效率的要求，僅適用於一般診療操作時阻隔操作者口腔和鼻腔撥出的汙染物。
